海军与海贼的顶上战争结束之后，路飞痛不欲生，甚平的一席话让路飞想起自己还有一群伙伴。 分散各地的草帽海贼团也都分别接到了艾斯死去的消息。都纷纷要回到路飞的身边，因为他们的船长需要他们。为了两年后更好的保护伙伴，大家开始了各自的修行。路飞跟随雷利学习霸气，索隆跟随鹰眼学习剑术，娜美去了天气岛学习天候，乌索普跟随英雄学习生存技巧，弗兰奇到了机关岛学习先进的科技，罗宾在一个巨大的桥上劳改期间遇到了路飞的老爸，乔巴去了一个巨鸟和原始人天天打仗的岛，而山治则去了人妖岛...