战斗中，芙蕾带着“打开门的钥匙”乘上救生舱离开了威萨利乌斯号，并发出了救命信号。听到芙蕾的声音后，基拉迅即赶往救生舱，但却为三个强化人所阻拦，救生舱被主天使号回收成功。终于得到了“打开门的钥匙”里关于“中子干扰消除器”的情报，阿兹拉艾尔不禁大喜过望。脱离了大气圈的草剃号和大天使号准备前往位于L4的废弃了的殖民卫星群。在PLANT，帕特利克·萨拉的肃正行动仍在继续；而克莱茵派也针锋相对地在地下持续进行着反战宣传。一直追求以和平方式来解决争端的前最高评议会议长西格尔·克莱茵在肃正行动中被射杀。 遭到主天使号和ZAFT舰队夹击的大天使号等三艘战舰突破了ZAFT舰队的阻击。草剃号和永恒号向ZAFT的旗舰威萨利乌斯号合力发动了攻击。在曾经的部下阿斯兰和迪亚克的敬礼中，亚迪斯舰长和威萨利乌斯号永远地消失在漆黑的宇宙之中。 由于主天使号的三个强化人都达到了活动的界限，ZAFT方面也失去了旗舰威萨利乌斯号，大天使号等终于在激战中得以生还，但受伤醒来的基拉却因未能救出芙蕾而十分愧疚，在拉克丝的膝上痛哭不已。